Advances in sequence analysis

[编者的话]

这是一篇很好的综述，如果你对比较基因组学和基因序列分析以及代谢网络调控机制的生物信息学研究感兴趣，那么建议阅读此文。在早几年里，整个计算生物学领域都在围绕着序列做文章。但是，在最近，许多并不基于序列的研究领域已经成为主流，从生物芯片的基因表达谱分析到whole-genome association discovery，再到基因调控网络的反向工程研究。然而，人类基因组测序计划的完成以及其他物种的序列的不断增加，序列数仍然是真正的、富含有价值的生物信息的宝矿，这个宝矿可以以不同的方法进行挖掘。进一步来说，将序列数据与一系列其他信息整合起来就能为生物过程的理解提供有价值的、重要的信息。这篇文章综述了序列分析的已有的方法，以及目前出现的新的相关的计算生物学的理论和方法，为我们以后的研究提供了指导。

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