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All motifs are NOT created equal: |
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(Eisen, 2005)
评论 在基因组序列中寻找转录因子结合位点是当前一个比较时髦的话题，繁多的方法（计算机方法、实验方法、理论推测等等）被应用到这个领域。实际上，在但这些方法都基于同样一个前提假设“在基因组中，当同一个TF有多个结合位点，这些结合位点在转录调控水平上将被一视同仁（等概率使用）”。在这篇文章中，作者认为这个前提假设有不妥之处，由于物理化学（结构学，生物化学）规律的限制，这些结合位点不太可能被等概率的使用。作者提出在他们实验室后续的工作当中，将会从结构和生化水平来考虑TF结合位点的使用倾向性。
Reference List Eisen,M. (2005). All motifs are NOT created equal: structural properties of transcription factor-DNA interactions and the inference of sequence specificity. Genome Biology 6, 7.
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1999-2005 中国科学院上海生命科学研究院生物信息中心 |
