2008年北京高血压联盟研究所（BHLI）第五届遗传统计学培训课程 |
| 来源：丁香园 作者：无 发布时间：2007-12-03 |
| 2008年北京高血压联盟研究所（BHLI） 第五届遗传统计学培训课程 2008年1月22－25日 本课程由北京高血压联盟研究所和科技部人类遗传项目共同组办。主要讲解人类致病基因的遗传学统计方法，适用于,遗传统计学初学人员及有一定遗传统计分析软件使用经验的科研人员 一、 培训内容： 参数分析；群体遗传学关联性研究；孪生同胞和大家族等位基因共享分析（非参数）；精细作图；混合连锁（杂合子）；样本量估计；经验P值估计。 蒙德尔遗传作图等较复杂内容的课程将就理论和实际操作进行共同讲解。上机训练将使用到如LINKAGE, MERLIN, GENEHUNTER, ALLEGRO, SIMWALK2, SNPHAP 等分析软件。此外，在今年的培训中将特别加入选择tagSNP和非同义SNP的部分。实际操作练习时会共用电脑，最好自备电脑。 二、主讲专家： Suzanne Leal，教授，德克萨斯州休斯顿Baylor医学院教授。 黄尚志，教授，中国医学科学院 Jurg Ott，教授，洛克菲勒大学遗传统计学实验室主任，北京遗传所。 三、 培训时间和地点： 1．时间：2008年1月22日至25日 2．地点：北京大学东门法学楼1号楼2层5203社会学系多媒体会议室 可提供约60个听课席位。 3．乘车路线： 特4路，特6路，运通105线，运通205线，319路，320路，331路，365路，375路，498路，656路，681路，683路，690路，697路，699路，717路，743路，801路，814路，826路公交车清华西门站，对面即到。 四、报名事宜： 1．费用2000元。请到会议注册时交费（支票或现金）。该费用包含学费、课程相关的花费（如学习材料等）及其午餐费，但不包括住宿费用。我们可以帮助参加者安排食宿，但费用自理。 2．报名方式：TEL: 8610－88681574，8610－88689073， 联系人：朱清英 Email：bhli200801@yahoo.com.cn 注 册 表 您的姓名: 工作单位: 地址: 工作部门： 电话: 传真: Email: 是否需要预定酒店(yes or no) 五、课程安排 1月22日，星期二 上午 课程： 基本术语，群体遗传学，LOD值计算，基因作图设计介绍，UNIX简要操作指南，连锁分析介绍，LINKAGE软件使用的文件系统，基因座类型，显性模式下的数据输入。 练习： 计算LOD值，检测Hardy－Weinberg平衡 上机练习：MLINK, ILINK, UNKOWN, PEDCHECK, MARKEPED, PREPLINK 下午 课程： 不完全外显，隐性疾病，性连锁特征，LOOP环对于连锁分析的重要意义 上机练习：同上午 1月23日 星期三 上午 课程： 遗传图谱，多位点连锁分析，连锁分析软件介绍，IBD(identity by descent 血源同一)，IBS(identity by state 地源同一)，孪生同胞和大家族的等位基因共享（非参数） 练习： 图距计算，杂和性，IBS,IBD，等位基因共享测试 上机练习：GENEHUNTER, MEGA2, SIMWALK2 ALLEGRO 下午： 连锁研究中的SNP数据分析――内标记连锁不平衡问题 练习： 基因作图设计 上机练习： MERLIN――在没有蒙德尔异常的情况下检查基因型检测错误 1月24日 星期四 上午 课程： 组建单体型，测量连锁不平衡，选择tagSNPs，样本－对照研究，HapMap, 家族关联研究，人群混合/分层 练习： TDT, 分析样本对照数据，D’ 和 r2 上机练习： SNPHAP, UNPHASED, PHASED 下午 课程： 检测与年龄相关的黄斑退行性改变患者中补体因子H基因的变化：一个成功的关联研究案例 1月25日 星期五 上午 课程： 连锁混合 练习： 计算HLODS 示范： 计算机在精细作图和基因识别中的应用 下午 课程： 样本量估计，幂和经验P值 上机练习： SLINK,MSIM Beijing Hypertension League Institute(BHLI) FiFth Annual Statistical Genetics Training Course JANUARY 22-25, 2008 We are pleased to announce the annual genetics course organized by Beijing Hypertension League Institute and National department of science and technology of human genetics project. This course is mainly focused on strategies for genetic mapping of human disease genes. The course is for researchers with no or a little experience in using statistical genetic analysis programs. The course will take place in Room 5203, 2th floor; Multimedia Room of Sociology Department; No. 1 Law building; Peking University; Beijing China. from January 22th to 25rd,2008. The number of participants is limited to around 60. Please be advised that participants will need laptops when working on the practical exercises. For additional information, please contact Ms.Zhu Qingying朱清英bhli200801@yahoo.com.cn Tel: 8610-8868-9073，8610－88681574 Emphasis: Strategies for genetic mapping of human Mendelian and complex traits, covering both theory and applied exercises. Computer exercises will be carried out using a variety of programs (LINKAGE, GENEHUNTER, ALLEGRO, SIMWALK2, SNPHAP, COCAPHASE, etc). A new exercise for selecting tagSNP and nonsynonymous SNPs will be added this year. Topics: parametric methods; allele sharing (nonparametric) methods for sib-pairs and extended families; fine mapping; linkage admixture (heterogeneity); association studies; sample size estimation and estimating empirical p-values. Instructors: Suzanne Leal, Ph.D., Professor, Baylor College of Medicine, Houston, Texas Xuezhong Huang, Professor, Chinese Academy of Medical Sciences. Jurg Ott, Ph.D., Professor, Rockefeller University New York and Beijing Genomics Institute Syllabus Tuesday, January 22 Morning Lecture: Basic terminology, population genetics, calculating lod scores, Introduction to linkage analysis, file system used by the LINKAGE programs, locus types, data entry for a dominant disease. Exercises: Calculating LOD scores, testing for Hardy-Weinberg Equilibrium Computer Exercises: MLINK, ILINK, UNKNOWN, PEDCHECK, MAKEPED, and PREPLINK Afternoon Lecture: Incomplete penetrance, recessive disease, sex-linked traits, loops, who is informative for linkage. Computer Exercises: Continued from the morning Wednesday, January 23 Morning Lecture: Genetic Maps, Multipoint linkage analysis, Overview of programs for linkage analysis. Exercises: Map distances, Heterozygosity Computer Exercises: GENEHUNTER. Afternoon Lecture: IBD (identity by descent), IBS (identity by state), Allele (nonparametric) sharing methods for both sib-pairs and extended families. Exercises: IBS, IBD and allele sharing tests Computer Exercises: ALLEGRO Thursday, January 24 Morning Lecture: Constructing Haplotypes, measures of linkage disequilibrium, selecting tag SNPs, case-control studies, HapMap, family based association studies, population admixture/stratification Afternoon Lecture: Analyzing SNP data for linkage studies- Problems of intermarker Linkage Disequilibrium Exercises: TDT, analyzing case control data, D’ and r2 Computer Exercises: SNPHAP, UNPHASED, PHASED Selecting TagSNPs (Haploview) and nonsynonymous SNPS Firday, January 25 Morning Lecture: Sample size estimation, power and empirical p-values for family and population based data Controlling Family Wise Error Rate (FWER) and False Discovery Rate Computer Exercises: SLINK, MSIM Afternoon Lecture: Designing a genetic study Linkage Admixture Exercise: Calculating HLODs |
| 最新评论： |