您热爱生物信息学并且准备立足于生物界吗？
您有数据分析的需求却苦于不知从何着手吗？
您对于软件繁杂的使用方法和众多参数不知如何取舍吗？
您面对众多的生物信息学分析软件却不知该如何选择应用吗？
……
华大基因帮你翻开生命科学事业新篇章。
这里有——
国际一流的生物信息专家
个性魅力的华大教师团队
浓厚的科研氛围
宝贵的华大内部学习机会
培训班的能给您带来的效果：
熟练掌握生物信息学种常用软件的下载、安装及使用；
具备独立分析基因组数据的能力，如组装、基因预测、功能注释、重复序列分析、SNP分析、芯片设计等一系列注释分析，以方便您更好的利用公共数据资源；
我们还可根据您实验室的具体问题提供相应的软硬件分析解决方案，建立起您自己的生物信息分析实验室。
招生对象：生物各学科的研究人员及在校学生。
授课方式：
以学习为主，不搞任何虚的东西，为期三个星期。
小班上课，最多10人，单机实习。理论授课结合具体案例分析，上机操作，教师亲自指点，讲授生物信息学常用软件，教你深入研究生物信息学，毕业颁发结业证。
课程内容安排：
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课程内容 |
具体内容 |
| 第一部分 |
一 Unix/Linux操作系统介绍 |
基本命令介绍
系统环境介绍
上机实习 |
| 二 数据的基本处理 |
(1)测序原理介绍:
(2)峰图转化：Phred、Phd2fasta
(3)载体屏蔽：Cross_match
(4)序列聚类拼接：Phrap、consed、Cap3
(5)引物设计：Primer3
上机实习 |
| 三 序列的比对 |
(1)全局比对: Clustalw、Mumer、Hmmer
(2）局部比对:
Blast、Blat、Blaatz、Genewise、Fasta、Sim4
Exonerate
上机实习 |
| 第二部分 |
四 基因组/基因注释分析 |
(1)重复序列分析: Repeatmasker、Trf
(2)RNA分析:tRNAScan、microrna、snorna、rrna
上机实习
基因预测:
A:原核生物及古菌 Glimmer
B:真核生物 GlimmerM、Genscan、Twinscan、BGF
(4) 基因功能注释:
Nt、Nr、SwissProt、Kegg、Interpro、GO(WEGO)
上机实习 |
| 五 SNP分析 |
Polyphred、SNPdetector、Crossmatch
上机实习 |
| 六 分子进化专题 |
(1) 进化树，分歧年代计算: Phylip、PAML、FGF、Mega
(2) 进化压力: kaks_calculator、K_estimator
上机实习 |
| 第三部分 |
七 基因表达分析专题 |
(1) 表达序列标签（EST）分析:
A EST数据的基本处理; B 差异表达分析;
C 功能注释及分类
上机实习
(2) 生物芯片(Microarray)分析:
A 芯片介绍 ; B Oligo设计; C 芯片数据分析
(3)Motif预测:
A Meme/Mast; B MDScan
上机实习 |
| 八 蛋白质结构预测专题 |
(1) 保守区域（domain)预测: Interpro、Pfam
(2) 信号胎的预测: SignalP
上机实习
(3) 跨膜区结构预测: TMHMM、SOSUI
(4) 三维结构预测: BGI Protein Pipeline
上机实习 |
| 第四部分 |
九 公用数据介绍 |
NCBI、EST、STS、SNP、Genome、cDNA、UCSC、NSEMBL、SWISSPROT、PDB、Rice Genome、Silkworm Genome、Treefam |
时间安排：
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培训班编号
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开课时间
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授课地点
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地址
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第十期
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2008年3月24日-4月5日
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杭州华大基因研究中心
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浙江省杭州市之江路51号浙大之江校区15号楼
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每两月一期，具体时间请随时关注本公司网站或通过电话邮件咨询
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培训费用：5000元（含讲课费、上机费、资料费)
电话报名：0571－2895 5895 刘 丽 0755－2527 3794 丛丽娟
邮件报名：train@genomics.org.cn ; train@genomics.com.cn
热忱欢迎各位有识之士报名参加。名额20人，报名从速。
想对我们了解更多，请登录以下网站查：
杭州华大基因研发中心
北京华大基因研究中心
深圳华大基因研究院
住宿：浙大之江校区招待所，标准间（双人间）50元/人/天。
有百年历史的浙大校园，环境清幽，景色宜人。
就餐：浙大学生食堂。
以上费用自理。
注：
1.请携带本人2张一寸免冠照片，身份证。如果是学生，请带学生证。
2.请携带学费汇款回执或复印件！
谢谢合作！
汇款到以下帐户：
开户行：杭州市商业银行之江度假区支行
账户名：杭州华大基因研发中心
账 号：7741 8100 0126 81
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