两种果蝇高含量GC碱基对之谜仍未解

许多研究发现，saltans果蝇和willistoni果蝇很少使用GC作为终止密码子，内含子中也很少含有GC碱基对。关于这种模式有两种解释，一种认为是突变形成的，一种认为这两种果蝇的偏爱密码子和非偏爱密码子本来就与众不同。

为了对此问题有深一步了解，研究人员在saltans/willistoni果蝇中，利用无活性的Q－样逆转录转座子（Q-like retrotransposable element）对背景替换模式（background substitutional patterns，生物通编者译）进行定量分析。发现，saltans/willistoni果蝇背景替换模式变化很大，主要是因为突变偏爱性的改变。这些差异提示saltans/willistoni果蝇与melanogaster等果蝇相比，基因组中所含的GC碱基对少很多，差异主要是内含子GC含量高的主要原因，但不足以解释saltans/willistoni果蝇与其它果蝇相比，为何密码子偏爱性发生改变。

研究人员推测，saltans/willistoni果蝇密码子使用频率的改变可能是种属的偏爱密码子和非偏爱密码子具有特异性，也可能是saltans/willistoni果蝇密码子偏爱性的不牢固选择压力所致。

研究结果刊登于10月18日电子版《BMC Biology》。