GCG软件使用简介

GCG软件使用简介

GCG软件是一套蛋白质、核酸序列分析软件。它提供了约130个程序。范围涉及：序列motif、关键词、同源性数据库搜索，序列比较，进化分析，序列两级结构分析，限制性酶切图谱，引物设计，序列模式识别，翻译，片段拼接等。现在我们生命院开放使用的是GCG的WWW版本SEQWEB。SEQWEB提供的数据库每二个月更新一次。
网址：http://gcg.biosino.org:8080/

研究人员一旦申请了一个用户，就可使用浏览器访问SEQWEB。客户要使用Netscape Version 4.04 或Internet Explorer Version 4.0 以上，并且要求java功能完好。以下分别介绍几个窗口，以此作为初学者的入门。

一、主窗口

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左帧是用于按类找相关的程序；右帧用于详细挑选你要用的程序；下帧用于开启其他的窗口。下帧中的“Introduction”是该软件包的简介；“Sequence Manager”使进入“序列管理、项目管理、分析结果管理”窗口；“Preferences”是用户自身设置（如用户口令）；“Support”里包含GCG公司的技术支持的通讯方法；“Help”包含了每一个程序的详细说明。

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二、程序窗口

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当你选定了一个程序后，再选择要分析的序列（如aa）及合适的参数，按下“Run” 按钮，程序就开始运行了。序列的分析结果会反送到你当前的浏览器窗口，并保留在远程计算机上你的用户里。在你的分析结果还没有送回期间，此浏览器的窗口不得挪作他用！如你一定要运行另一个程序，则可在此窗口中用“文件---新建---窗口”的方法创建一个新的窗口，在新窗口中运行另一个程序。（2000年底的新版本软件将支持批处理功能）

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三、序列管理、项目管理、分析结果管理窗口

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在主窗口中按“Sequence Manager”按钮就进入次窗口。