系统分类
多序列联配
变异
论文
流行病学
病毒筛选
毒株信息
编号:
OEAV104969
发布时间:
2020-03-01
基因组完整性:
complete
病毒类型
RNA viruses
毒株名称:
Pipistrellus bat coronavirus HKU5 isolate BY140535
毒株别名:
-
病毒说明:
Pipistrellus bat coronavirus HKU5 isolate BY140535, complete genome
物种名称:
Pipistrellus bat coronavirus HKU5
物种ID:
694008
属名:
Betacoronavirus
分类谱系:
[root, Viruses, Riboviria, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Merbecovirus, Pipistrellus bat coronavirus HKU5]
序列长度:
30494
有效碱基数量:
30494
有效碱基百分比:
100.00%
宿主:
-
宿主补充信息:
-
分离来源:
-
测序技术:
Illumina; Sanger dideoxy sequencing
组装方法:
Lasergene Seqman v. V7.0
覆盖度:
-
相关链接:
MH002340
提交者:
Luo,C.M., Wang,N., Zhang,W., Li,B. and Shi,Z.L.
提交者单位:
Wuhan Institute of Virology
提交者地址:
Chinese Academy of Sciences, Xiao Hong Shan 44, Room 211, Wuchang District, wuhan, hubei 430071, China
样本信息
编号:
OESV104969
采样时间:
2014-06-26
病毒注释
NC_045512.2:28144:
GTAACATTAGGGAGGACTTGAAAGAGCCACCACATTTTCACCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTACAGTGAACAATGCTAGGGAGAGCTGCCTATATGGAAGAGCCCTAATGTGTAAAATTAATTTTAGTAGTGCTATCCCCATGTGATTTTAATAGCTTCTTAGGAGAATGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
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GTAACATTAGGGAGGACTTGAAAGAGCCACCACATTTTCACCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTACAGTGAACAATGCTAGGGAGAGCTGCCTATATGGAAGAGCCCTAATGTGTAAAATTAATTTTAGTAGTGCTATCCCCATGTGATTTTAATAGCTTCTTAGGAGAATGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
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以下
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毒株也检测到该变异
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Collection Date
OEAV000001
BetaCoV/Anhui/SZ005/2020