毒株信息
编号： OEAV1061293 发布时间： 2021-03-15 基因组完整性： -
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/dog/USA/CT-CVMDL-1/2021
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/dog/USA/CT-CVMDL-1/2021
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29869
有效碱基数量：
29869
有效碱基百分比：
100.00%
宿主：
Canis lupus familiaris
宿主补充信息：
German Shepherd dog, pet dog
分离来源：
-
测序技术：
Illumina iseq100
组装方法：
Minimap2
覆盖度：
10,054x
相关链接：
EPI_ISL_1241386
提交者：
Dong-Hun Lee, Zeinab H. Helal, Junwon Kim, Amelia Hunt, Alyza Barbieri, Ji-yeon Hyeon, David H. Chung, Guillermo Risatti
提交者单位：
Department of Pathobiology, University of Connecticut
提交者地址：
61 North Eagleville Rd. Unit 3089, Storrs, CT 06269, USA
样本信息
编号： OESV1061293 采样时间： 2021-02-12
采样地点：
North America / USA / Connecticut
地点补充信息：
-
宿主编号：
-
宿主性别：
Female
宿主年龄：
3 months
采样单位：
Connecticut Veterinary Medical Diagnostic Laboratory
采样地址：
61 North Eagleville Rd. Unit 3089, Storrs, CT 06269, USA