毒株信息
编号: OEAV1108511 发布时间: 2021-03-24 基因组完整性: -
病毒类型
RNA virus
毒株名称:
hCoV-19/cat/France/IDF-CH2/2020
毒株别名:
-
病毒说明:
hCoV-19/cat/France/IDF-CH2/2020
物种名称:
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID:
属名:
Betacoronavirus
分类谱系:
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度:
322
有效碱基数量:
318
有效碱基百分比:
98.76%
宿主:
Felis catus
宿主补充信息:
-
分离来源:
Oropharyngeal swab
测序技术:
Nanopore MinION
组装方法:
minimap2
覆盖度:
-
相关链接:
提交者:
Meriadeg AR GOUILH, Nicolas NESI, Matthieu FRITZ, Estelle LEPERCHOIS, Astrid VABRET
提交者单位:
GRAM2.0, Université de Caen Normandie / Laboratoire de Virologie, CHU de Caen
提交者地址:
Université de Caen Normandie, Esplanade de la Paix, 14000, Caen, France / Laboratoire de Virologie, CHU de Caen, Avenue Georges Clémenceau, 14000, Caen, France.
样本信息
编号: OESV1108511 采样时间: 2020-11-20
采样地点:
Europe / France / Ile de France
地点补充信息:
-
宿主编号:
-
宿主性别:
Male
宿主年龄:
13
采样单位:
VEBIO
采样地址:
41 Bis Avenue Aristide Briand, 94110 Arcueil