毒株信息
编号： OEAV1130654 发布时间： 2021-03-23 基因组完整性： -
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/dog/USA/TX-TAMU-21-005988-002-466/2021
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/dog/USA/TX-TAMU-21-005988-002-466/2021
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29784
有效碱基数量：
29784
有效碱基百分比：
100.00%
宿主：
Canis lupus familiaris
宿主补充信息：
Black lab-mix dog
分离来源：
Oral swab (PCR Cts~28-29)
测序技术：
MiSeq
组装方法：
DNAStar SeqMan NGen v14.1.0
覆盖度：
2,741.96x (median)
相关链接：
EPI_ISL_1315074
提交者：
Kerrie M. Franzen, Mary L. Killian, Emily R. Love, Sarah A. Hamer, Gabriel L. Hamer, Ria R. Ghai, Casey Barton Behravesh, Ailam Lim
提交者单位：
Diagnostic Virology Laboratory, National Veterinary Services Laboratories, USDA1920 Dayton Avenue, Ames, IA 50010, USA
提交者地址：
1920 Dayton Avenue, Ames, IA 50010, USA
样本信息
编号： OESV1130654 采样时间： 2021-02-12
采样地点：
North America / USA / Texas / Brazos County
地点补充信息：
Same household as TAMU-467
宿主编号：
-
宿主性别：
Male
宿主年龄：
15
采样单位：
Texas A&M College of Veterinary Medicine & Biomedical Sciences via Wisconsin Veterinary Diagnostic Laboratory, University of Wisconsin-Madison
采样地址：
Texas A&M College of Veterinary Medicine & Biomedical Sciences, 4461 TAMU, College Station, TX 77843-4461