系统分类
多序列联配
变异
论文
流行病学
病毒筛选
毒株信息
编号:
OEAV118756
发布时间:
2018-11-21
基因组完整性:
complete
病毒类型
RNA viruses
毒株名称:
SARS coronavirus Urbani isolate icSARS
毒株别名:
-
病毒说明:
SARS coronavirus Urbani isolate icSARS, complete genome
物种名称:
SARS coronavirus Urbani
物种ID:
228330
属名:
Betacoronavirus
分类谱系:
[root, Viruses, Riboviria, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus, SARS coronavirus Urbani]
序列长度:
29727
有效碱基数量:
29727
有效碱基百分比:
100.00%
宿主:
Homo sapiens
宿主补充信息:
-
分离来源:
-
测序技术:
Sanger dideoxy sequencing
组装方法:
-
覆盖度:
-
相关链接:
MK062179
提交者:
Graham,R.L., Deming,D.J., Deming,M.E., Yount,B.L. and Baric,R.S.
提交者单位:
Epidemiology, University of North Carolina at Chapel Hill
提交者地址:
2107 McGavran-Greenberg CB7435, Chapel Hill, NC 27599, USA
样本信息
编号:
OESV118756
采样时间:
2017-05-27
病毒注释
NC_045512.2:28144:
GTAACATTAGGGAGGACTTGAAAGAGCCACCACATTTTCACCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTACAGTGAACAATGCTAGGGAGAGCTGCCTATATGGAAGAGCCCTAATGTGTAAAATTAATTTTAGTAGTGCTATCCCCATGTGATTTTAATAGCTTCTTAGGAGAATGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
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GTAACATTAGGGAGGACTTGAAAGAGCCACCACATTTTCACCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTACAGTGAACAATGCTAGGGAGAGCTGCCTATATGGAAGAGCCCTAATGTGTAAAATTAATTTTAGTAGTGCTATCCCCATGTGATTTTAATAGCTTCTTAGGAGAATGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
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以下
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毒株也检测到该变异
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virus name
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Collection Date
OEAV000001
BetaCoV/Anhui/SZ005/2020