系统分类
多序列联配
变异
论文
流行病学
病毒筛选
毒株信息
编号:
OEAV140838
发布时间:
2020-02-10
基因组完整性:
complete
病毒类型
RNA viruses
毒株名称:
ZV2011 segment M
毒株别名:
-
病毒说明:
Zwiesel bat banyangvirus isolate ZV2011 segment M, complete sequence
物种名称:
Zwiesel bat banyangvirus
物种ID:
2706560
属名:
Banyangvirus
分类谱系:
[root, Viruses, Riboviria, Negarnaviricota, Polyploviricotina, Ellioviricetes, Bunyavirales, Phenuiviridae, Banyangvirus, unclassified Banyangvirus, Zwiesel bat banyangvirus]
序列长度:
3434
有效碱基数量:
3432
有效碱基百分比:
99.94%
基因型:
-
所在片段:
M
宿主:
Eptesicus nilssonii
宿主补充信息:
-
分离来源:
heart, feces, abdominal cavity, lung
测序技术:
Illumina
组装方法:
Velvet assembler v. 1.2.10
覆盖度:
-
相关链接:
MN823640
提交者:
Kohl,C., Brinkmann,A., Radonic,A., Dabrowski,P.W., Nitsche,A., Muhldorfer,K., Wibbelt,G. and Kurth,A.
提交者单位:
Centre for Biological Security, Robert Koch Institute
提交者地址:
Seestrasse 10, Berlin, Berlin 13353, Germany
样本信息
编号:
OESV140838
采样时间:
2011-01-01
病毒注释
NC_045512.2:28144:
GTAACATTAGGGAGGACTTGAAAGAGCCACCACATTTTCACCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTACAGTGAACAATGCTAGGGAGAGCTGCCTATATGGAAGAGCCCTAATGTGTAAAATTAATTTTAGTAGTGCTATCCCCATGTGATTTTAATAGCTTCTTAGGAGAATGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
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GTAACATTAGGGAGGACTTGAAAGAGCCACCACATTTTCACCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTACAGTGAACAATGCTAGGGAGAGCTGCCTATATGGAAGAGCCCTAATGTGTAAAATTAATTTTAGTAGTGCTATCCCCATGTGATTTTAATAGCTTCTTAGGAGAATGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
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以下
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毒株也检测到该变异
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virus name
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Collection Date
OEAV000001
BetaCoV/Anhui/SZ005/2020