毒株信息
编号： OEAV1470943 发布时间： 2021-04-27 基因组完整性： -
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/lion/Spain/CT-ZooBarcelona-CR_162.1.1-R009AO3D1/2020
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/lion/Spain/CT-ZooBarcelona-CR_162.1.1-R009AO3D1/2020
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29515
有效碱基数量：
18681
有效碱基百分比：
63.29%
宿主：
Panthera leo
宿主补充信息：
-
分离来源：
Nasopharyngeal swab
测序技术：
Illumina MiSeq
组装方法：
viralrecon/ivar
覆盖度：
671.32x
相关链接：
EPI_ISL_1740499
提交者：
J.Rodon, L. Fernández-Bastit, M. Noguera-Julian, M. Casadellà, M. Parera, F. Català-Moll, R. Paredes, B. Clotet, H. Fernández-Bellón, J. Vergara-Alert
提交者单位：
IrsiCaixa
提交者地址：
Fundació irsiCaixa. Hospital Universitari Germans Trias i Pujol(HUGTiP), 2a planta, maternal Ctra Canyet s/n, Badalona
样本信息
编号： OESV1470943 采样时间： 2020-11-13
采样地点：
Europe / Spain / Catalunya / Barcelona
地点补充信息：
Zoologic
宿主编号：
-
宿主性别：
Female
宿主年龄：
33
采样单位：
Zoo Barcelona | IRTA-CReSA
采样地址：
Parc Zoològic de Barcelona, Parc de la Ciutadella, s/n, 08003 Barcelona, Spain.Institut de Recerca i Tecnologia Agroalimentàries (IRTA), Centre de Recerca en Sanitat Animal (CReSA), Campus de la Universitat Autònoma de Barcelona, Bellaterra (Cerdanyola del Vallès), 08193 Barcelona, Spain.