毒株信息
编号： OEAV1470944 发布时间： 2021-04-06 基因组完整性： -
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/mink/Slovenia/D1/2020
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/mink/Slovenia/D1/2020
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29806
有效碱基数量：
29578
有效碱基百分比：
99.24%
宿主：
Mustela putorius furo
宿主补充信息：
-
分离来源：
Oropharyngeal swab
测序技术：
Illumina Miseq
组装方法：
SPAdes 3.14
覆盖度：
-
相关链接：
EPI_ISL_1490186
提交者：
Samo Zakotnik, Tomaž Mark Zorec, Matic Brvar, Miša Korva, Mario Poljak, Tatjana Avšič – Županc, Jožko Račnik, Brigita Slavec, Olga Zorman Rojs, Milan Matko, Ana Kočevar
提交者单位：
Institute of Microbiology and Immunology, Faculty of Medicine, University of Ljubljana
提交者地址：
Zaloška 4, SI-1000 Ljubljana
样本信息
编号： OESV1470944 采样时间： 2020-11-23
采样地点：
Europe / Slovenia
地点补充信息：
-
宿主编号：
-
宿主性别：
Male
宿主年龄：
5
采样单位：
University of Ljubljana, Faculty of Veterinary Medicine
采样地址：
Gerbičeva ulica 60, SI-1000 Ljubljana