毒株信息
编号: OEAV192114 发布时间: 2020-06-22 基因组完整性: -
病毒类型
RNA virus
毒株名称:
hCoV-19/pangolin/Guangdong/FM45-9/2019
毒株别名:
-
病毒说明:
hCoV-19/pangolin/Guangdong/FM45-9/2019
物种名称:
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID:
属名:
Betacoronavirus
分类谱系:
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度:
29762
有效碱基数量:
27847
有效碱基百分比:
93.57%
宿主:
Manis javanica
宿主补充信息:
-
分离来源:
muscle tissue
测序技术:
Illumina Novaseq 6000
组装方法:
MEGAHIT v1.0.3
覆盖度:
-
相关链接:
提交者:
Yongyi Shen, Wu Chen
提交者单位:
South China Agricultural University
提交者地址:
483 Wushan Road, Tianhe District, 510642 Guangzhou, China
样本信息
编号: OESV192114 采样时间: 2020-05-22
采样地点:
Asia / China / Guangdong
地点补充信息:
-
采样单位:
South China Agricultural University
采样地址:
483 Wushan Road, Tianhe District, 510642 Guangzhou, China