毒株信息
编号： OEAV192889 发布时间： 2020-06-28 基因组完整性： -
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/Ecuador/USFQ-004/2020
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/Ecuador/USFQ-004/2020
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29768
有效碱基数量：
29765
有效碱基百分比：
99.99%
宿主：
Homo sapiens
宿主补充信息：
Suspects to be infected in recent trip to Guayaquil
分离来源：
-
测序技术：
Nanopore MinION
组装方法：
Artic Network
覆盖度：
200x
相关链接：
EPI_ISL_477014
提交者：
Belen Prado-Vivar, Sully Marquez, Juan Jose Guadalupe, Monica Becerra-Wong, Carla Torres, Bernardo Gutierrez, Francisco Mora, Juan Gaviria, Alejandra Ramones, Franklin Espinoza, Edison Ligña, Jorge Reyes, Patricio Rojas-Silva, Veronica Barragan, Gabriel Trueba, Michelle Grunauer, Paul Cardenas
提交者单位：
Institute of Microbiology, Universidad San Francisco de Quito
提交者地址：
Diego de Robles SN y Via Interoceanica, Campus Cumbaya
样本信息
编号： OESV192889 采样时间： 2020-03-30
采样地点：
South America / Ecuador / Pichincha
地点补充信息：
Hospital General Sur de Quito
宿主编号：
-
宿主性别：
Female
宿主年龄：
73
采样单位：
Institute of Microbiology, Universidad San Francisco de Quito
采样地址：
Diego de Robles SN y Via Interoceanica, Campus Cumbaya