毒株信息
编号： OEAV194328 发布时间： 2020-06-25 基因组完整性： -
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/Senegal/57499/2020
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/Senegal/57499/2020
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29802
有效碱基数量：
27630
有效碱基百分比：
92.71%
宿主：
Homo sapiens
宿主补充信息：
-
分离来源：
Oro/naso-pharyngeal swabs
测序技术：
Illumina Miseq
组装方法：
Bowtie2
覆盖度：
-
相关链接：
EPI_ISL_476151
提交者：
Ndongo Dia, Moussa Moise Diagne, Mamadou Diop, Ousmane faye, Amadou Alpha Sall
提交者单位：
Institut Pasteur de Dakar
提交者地址：
36, avenue Pasteur 221 Dakar Senegal
样本信息
编号： OESV194328 采样时间： 2020-06-09
采样地点：
Africa / Senegal / Dakar
地点补充信息：
-
宿主编号：
-
宿主性别：
Male
宿主年龄：
14
采样单位：
Institut Pasteur Dakar
采样地址：
36, avenue Pasteur 221 Dakar Senegal