毒株信息
编号： OEAV202219 发布时间： 2020-07-06 基因组完整性： -
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/cat/Spain/CT-IrsiCaixa-G5/2020
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/cat/Spain/CT-IrsiCaixa-G5/2020
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29541
有效碱基数量：
15988
有效碱基百分比：
54.12%
宿主：
Felis catus
宿主补充信息：
-
分离来源：
-
测序技术：
Illumina MiSeq
组装方法：
Bowtie2/Samtools
覆盖度：
20x
相关链接：
EPI_ISL_482820
提交者：
J. Segalés, M. Puig, J. Rodon, C. Avila-Nieto, J. Carrillo, G. Cantero, M.T. Terrón, S. Cruz, M. Parera ,M. Noguera-Julián, N. Izquierdo-Useros, V. Guallar, E. Vidal, A. Valencia, I. Blanco, J. Blanco, B. Clotet, J. Vergara-Alert
提交者单位：
IrsiCaixa AIDS Research Lab
提交者地址：
Hospital Can Ruti, 2a planta, maternal, Ctra Canyet s/n. Badalona, 08916, Spain.
样本信息
编号： OESV202219 采样时间： 2020-04-23
采样地点：
Europe / Spain / Catalunya / Barcelona
地点补充信息：
-
宿主编号：
-
宿主性别：
Male
宿主年龄：
4
采样单位：
Centre de Recerca en Sanitat Animal (IRTA-CReSA)
采样地址：
IRTA-CReSA Centre de Recerca en Sanitat Animal Campus UAB. Edifici CReSA. 08193 Bellaterra (Barcelona)