毒株信息
编号： OEAV210211 发布时间： 2020-05-30 基因组完整性： partial
病毒类型
RNA viruses
毒株名称：
SARS-CoV-2/environment/PAK/PAK-RIU-ES-01/2020 ORF1ab polyprotein (ORF1ab) and ORF1a polyprotein (ORF1ab) genes
毒株别名：
-
病毒说明：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/environment/PAK/PAK-RIU-ES-01/2020 ORF1ab polyprotein (ORF1ab) and ORF1a polyprotein (ORF1ab) genes, partial cds
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[root, Viruses, Riboviria, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus, Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]
序列长度：
346
有效碱基数量：
346
有效碱基百分比：
100.00%
宿主：
wastewater metagenome
宿主补充信息：
-
分离来源：
wastewater;sewage sample
测序技术：
Sanger dideoxy sequencing
组装方法：
-
覆盖度：
-
相关链接：
MT539157
提交者：
Sharif,S., Khurshid,A., Mahmood,N., Arshad,Y., Salman,M., Ikram,A., Badar,N., Umair,M., Tamim,S., Angez,M., Alam,M. and Ahad,A.
提交者单位：
Virology
提交者地址：
National Institute of Health, WHO Regional Reference Laboratory for Polio Eradication, Virology Department, National Institute of, Islamabad 44000, Pakistan
样本信息
编号： OESV210211 采样时间： 2020-04-17
病毒注释