毒株信息
编号: OEAV2129572 发布时间: 2021-05-05 基因组完整性: -
病毒类型
RNA virus
毒株名称:
hCoV-19/cat/Argentina/PAIS-A0344/2020
毒株别名:
-
病毒说明:
hCoV-19/cat/Argentina/PAIS-A0344/2020
物种名称:
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID:
属名:
Betacoronavirus
分类谱系:
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度:
29812
有效碱基数量:
28025
有效碱基百分比:
94.01%
宿主:
Felis catus
宿主补充信息:
-
分离来源:
-
测序技术:
Illumina NextSeq 500
组装方法:
custom
覆盖度:
-
相关链接:
提交者:
Nadia Analía Fuentealba, Gastón More, María Emilia Bravi, Juan Manuel Unzaga, Lorena De Felice, Marcos Salina, Mariana Viegas, Mercedes Soledad Nabaes Jodar, Laura Elena Valinotto, Fernando David Rivero, David Di Llulo, Marcelo Pecoraro, Carlos Javier Panei
提交者单位:
Área de Secuenciación del Laboratorio de Virología del Hospital de Niños Dr. Ricardo Gutierrez on behalf of 'Proyecto Argentino Interinstitucional de genomica de SARS-CoV-2' (PAIS Consortium)
提交者地址:
Gallo 1330 2do piso (C1425EFD) CABA
样本信息
编号: OESV2129572 采样时间: 2020-09-05
采样地点:
South America / Argentina / Buenos Aires / La Plata
地点补充信息:
-
采样单位:
Unidad de diagnóstico COVID-19, Facultad de Ciencias Veterinarias (FCV), Universidad Nacional de La Plata (UNLP), Argentina.
采样地址:
Av. 60 y 118, B1900 La Plata, Provincia de Buenos Aires