毒株信息
编号: OEAV2129731 发布时间: 2021-05-18 基因组完整性: -
病毒类型
RNA virus
毒株名称:
hCoV-19/mink/Latvia/2104/2021
毒株别名:
-
病毒说明:
hCoV-19/mink/Latvia/2104/2021
物种名称:
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID:
属名:
Betacoronavirus
分类谱系:
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度:
29871
有效碱基数量:
29871
有效碱基百分比:
100.00%
宿主:
Neovison vison
宿主补充信息:
-
分离来源:
-
测序技术:
DNBSEQ-G400RS, MGI Tech Co., Ltd
组装方法:
bwa-mem
覆盖度:
20861x
相关链接:
提交者:
Janis Pjalkovskis, Nikita Zrelovs, Monta Ustinova, Ivars Silamikelis, Liga Birzniece, Kaspars Megnis, Una Krumina, Guntars Zarins, Vita Rovite, Lauma Freimane, Laila Silamikele, Laura Ansone, Davids Fridmanis, Elina Dimina, Irena Meistere, Daina Pule, Jurijs Perevoscikovs, Uga Dumpis, Janis Klovins
提交者单位:
Latvian Biomedical Research and Study Centre
提交者地址:
Ratsupites 1, Riga, LV-1067, Latvia
样本信息
编号: OESV2129731 采样时间: 2021-04-12
采样地点:
Europe / Latvia
地点补充信息:
-
采样单位:
BIOR
采样地址:
Lejupes iela 3, Riga, Latvia