毒株信息
编号： OEAV2135008 发布时间： 2021-05-28 基因组完整性： partial
病毒类型
RNA viruses
毒株名称：
SARS-CoV-2/human/USA/GA-EHC-889G/2020 ORF1ab polyprotein (ORF1ab), ORF1a polyprotein (ORF1ab), surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), ORF6 protein (ORF6), and ORF7a protein (ORF7a) genes, complete cds; ORF7b (ORF7b) and ORF8 protein (ORF8) genes, partial cds; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes
毒株别名：
-
病毒说明：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/USA/GA-EHC-889G/2020 ORF1ab polyprotein (ORF1ab), ORF1a polyprotein (ORF1ab), surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), ORF6 protein (ORF6), and ORF7a protein (ORF7a) genes, complete cds; ORF7b (ORF7b) and ORF8 protein (ORF8) genes, partial cds; and nucleocapsid phosphoprotein (N) and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[root, Viruses, Riboviria, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus, Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]
序列长度：
29867
有效碱基数量：
29523
有效碱基百分比：
98.85%
宿主：
Homo sapiens
宿主补充信息：
-
分离来源：
-
测序技术：
Illumina
组装方法：
IRMA v. v0.9.5-beta
覆盖度：
-
相关链接：
MZ313013
提交者：
Piantadosi,A., Babiker,A., Sheth,M., Nobles,S., Padilla,J., Burroughs,M., Davis,M., Cook,P., Paden,C.R., Batra,D., Knipe,K., Howard,D., Unoarumhi,Y., Schmerer,M., Rambo-Martin,B.L., Lacek,K., Shepard,S., Laufer Halpin,A., Wentworth,D., Dugan,V. and Lee,J.
提交者单位：
Division of Viral Diseases, CDC Pathogen Discovery Team
提交者地址：
1600 Clifton Road, Atlanta, GA 30329, USA
样本信息
编号： OESV2135008 采样时间： 2020-11-16
病毒注释