系统分类
多序列联配
变异
论文
流行病学
病毒筛选
毒株信息
编号:
OEAV2152500
发布时间:
2021-05-18
基因组完整性:
partial
病毒类型
RNA viruses
毒株名称:
Sequence 4 from Patent WO2021072035
毒株别名:
-
病毒说明:
Sequence 4 from Patent WO2021072035
物种名称:
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID:
2697049
属名:
Betacoronavirus
分类谱系:
[root, Viruses, Riboviria, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus, Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]
序列长度:
67
有效碱基数量:
67
有效碱基百分比:
100.00%
宿主:
Patent WO2021072035
宿主补充信息:
-
分离来源:
-
测序技术:
-
组装方法:
-
覆盖度:
-
相关链接:
MQ032646
样本信息
编号:
OESV2152500
采样时间:
2021-03-15
病毒注释
NC_045512.2:28144:
GTAACATTAGGGAGGACTTGAAAGAGCCACCACATTTTCACCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTACAGTGAACAATGCTAGGGAGAGCTGCCTATATGGAAGAGCCCTAATGTGTAAAATTAATTTTAGTAGTGCTATCCCCATGTGATTTTAATAGCTTCTTAGGAGAATGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
->
GTAACATTAGGGAGGACTTGAAAGAGCCACCACATTTTCACCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTACAGTGAACAATGCTAGGGAGAGCTGCCTATATGGAAGAGCCCTAATGTGTAAAATTAATTTTAGTAGTGCTATCCCCATGTGATTTTAATAGCTTCTTAGGAGAATGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
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以下
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毒株也检测到该变异
virus id
virus name
host
country
Collection Date
OEAV000001
BetaCoV/Anhui/SZ005/2020