系统分类
多序列联配
变异
论文
流行病学
病毒筛选
毒株信息
编号:
OEAV2218422
发布时间:
2021-05-31
基因组完整性:
-
病毒类型
RNA virus
毒株名称:
hCoV-19/Argentina/PAIS-S-F0005/2021
毒株别名:
-
病毒说明:
hCoV-19/Argentina/PAIS-S-F0005/2021
物种名称:
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID:
2697049
属名:
Betacoronavirus
分类谱系:
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度:
842
有效碱基数量:
842
有效碱基百分比:
100.00%
宿主:
Homo sapiens
宿主补充信息:
-
分离来源:
-
测序技术:
Sanger
组装方法:
-
覆盖度:
-
相关链接:
EPI_ISL_2348734
提交者:
L Pianciola, M Mazzeo, C Ziehm, C Pintos, M Fernandez, J Ousset, C Rastellini
提交者单位:
Laboratorio Central Mg. Luis Alfredo Pianciola on behalf of 'Proyecto Argentino Interinstitucional de genomica de SARS-CoV-2' (PAIS Consortium)
提交者地址:
Gregorio Martinez 65, Neuquen, Argentina
样本信息
编号:
OESV2218422
采样时间:
2021-04-21
采样地点:
South America / Argentina / Neuquen / San Martin de los Andes
地点补充信息:
-
宿主编号:
-
宿主性别:
Male
宿主年龄:
29
采样单位:
Hospital Regional Ramon Carillo
采样地址:
CORONEL RODHE 813
NC_045512.2:28144:
GTAACATTAGGGAGGACTTGAAAGAGCCACCACATTTTCACCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTACAGTGAACAATGCTAGGGAGAGCTGCCTATATGGAAGAGCCCTAATGTGTAAAATTAATTTTAGTAGTGCTATCCCCATGTGATTTTAATAGCTTCTTAGGAGAATGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
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以下
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virus id
virus name
host
country
Collection Date
OEAV000001
BetaCoV/Anhui/SZ005/2020