系统分类
多序列联配
变异
论文
流行病学
病毒筛选
毒株信息
编号:
OEAV230923
发布时间:
2020-08-01
基因组完整性:
-
病毒类型
RNA virus
毒株名称:
hCoV-19/Canada/AB-Z0001/2020
毒株别名:
-
病毒说明:
hCoV-19/Canada/AB-Z0001/2020
物种名称:
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID:
2697049
属名:
Betacoronavirus
分类谱系:
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度:
29866
有效碱基数量:
29861
有效碱基百分比:
99.98%
宿主:
environmental samples
宿主补充信息:
-
分离来源:
Wastewater from domestic sewage
测序技术:
Nanopore MinION
组装方法:
ARTIC Protocol
覆盖度:
1000X
相关链接:
EPI_ISL_504185
提交者:
Dustin Hittel, Marina Kerr, Leo Dimnik, Desmond Koo, Alice Li, Aneal Khan
提交者单位:
Discovery DNA
提交者地址:
1640 16 Ave NW #304, Calgary, AB T2M 0L6
样本信息
编号:
OESV230923
采样时间:
2020-05-13
采样地点:
North America / Canada / Alberta
地点补充信息:
Wastewater
采样单位:
Discovery DNA
采样地址:
1640 16 Ave NW #304, Calgary, AB T2M 0L6
NC_045512.2:28144:
GTAACATTAGGGAGGACTTGAAAGAGCCACCACATTTTCACCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTACAGTGAACAATGCTAGGGAGAGCTGCCTATATGGAAGAGCCCTAATGTGTAAAATTAATTTTAGTAGTGCTATCCCCATGTGATTTTAATAGCTTCTTAGGAGAATGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
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以下
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virus id
virus name
host
country
Collection Date
OEAV000001
BetaCoV/Anhui/SZ005/2020