系统分类
多序列联配
变异
论文
流行病学
病毒筛选
毒株信息
编号:
OEAV247514
发布时间:
2020-08-25
基因组完整性:
complete
病毒类型
RNA viruses
毒株名称:
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/mink/DK/AD6_Farm1/2020
毒株别名:
-
病毒说明:
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/mink/DK/AD6_Farm1/2020, complete genome
物种名称:
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID:
2697049
属名:
Betacoronavirus
分类谱系:
[root, Viruses, Riboviria, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus, Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]
序列长度:
29836
有效碱基数量:
29834
有效碱基百分比:
99.99%
宿主:
Neovison vison
宿主补充信息:
-
分离来源:
-
测序技术:
-
组装方法:
-
覆盖度:
-
相关链接:
MT919527
提交者:
Rasmussen,T.B., Fonager,J. and Rasmussen,M.
提交者单位:
Statens Serum Institut
提交者地址:
Artillerivej 5, Copenhagen S 2300, Denmark
样本信息
编号:
OESV247514
采样时间:
2020-06-14
病毒注释
NC_045512.2:28144:
GTAACATTAGGGAGGACTTGAAAGAGCCACCACATTTTCACCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTACAGTGAACAATGCTAGGGAGAGCTGCCTATATGGAAGAGCCCTAATGTGTAAAATTAATTTTAGTAGTGCTATCCCCATGTGATTTTAATAGCTTCTTAGGAGAATGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
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GTAACATTAGGGAGGACTTGAAAGAGCCACCACATTTTCACCGAGGCCACGCGGAGTACGATCGAGTGTACAGTGAACAATGCTAGGGAGAGCTGCCTATATGGAAGAGCCCTAATGTGTAAAATTAATTTTAGTAGTGCTATCCCCATGTGATTTTAATAGCTTCTTAGGAGAATGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
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以下
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毒株也检测到该变异
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Collection Date
OEAV000001
BetaCoV/Anhui/SZ005/2020