毒株信息
编号： OEAV461480 发布时间： 2021-01-14 基因组完整性： partial
病毒类型
RNA viruses
毒株名称：
SARS-CoV-2/Chlorocebus sabaeus/USA/MD_AGM_APR062020/2020 ORF1ab polyprotein (ORF1ab), ORF1a polyprotein (ORF1ab), surface glycoprotein (S), and ORF3a protein (ORF3a) genes, complete cds; envelope protein (E) and membrane glycoprotein (M) genes, partial cds; and ORF6 protein (ORF6), ORF7a protein (ORF7a), ORF7b (ORF7b), ORF8 protein (ORF8), nucleocapsid phosphoprotein (N), and ORF10 protein (ORF10) genes
毒株别名：
-
病毒说明：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/Chlorocebus sabaeus/USA/MD_AGM_APR062020/2020 ORF1ab polyprotein (ORF1ab), ORF1a polyprotein (ORF1ab), surface glycoprotein (S), and ORF3a protein (ORF3a) genes, complete cds; envelope protein (E) and membrane glycoprotein (M) genes, partial cds; and ORF6 protein (ORF6), ORF7a protein (ORF7a), ORF7b (ORF7b), ORF8 protein (ORF8), nucleocapsid phosphoprotein (N), and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[root, Viruses, Riboviria, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus, Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]
序列长度：
29807
有效碱基数量：
29152
有效碱基百分比：
97.80%
宿主：
Chlorocebus sabaeus
宿主补充信息：
-
分离来源：
oronasopharynx
测序技术：
Illumina
组装方法：
NGEN v. APR-2020
覆盖度：
-
相关链接：
MW477798
提交者：
Kugelman,J. and Beitzel,B.
提交者单位：
Center for Genome Sciences, USAMRIID
提交者地址：
1425 Porter Street, Ft Detrick, MD 21702, USA
样本信息
编号： OESV461480 采样时间： 2020-04-06
病毒注释