毒株信息
编号： OEAV577865 发布时间： 2021-01-20 基因组完整性： -
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/bat/Cambodia/RShSTT200/2010
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/bat/Cambodia/RShSTT200/2010
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29793
有效碱基数量：
29793
有效碱基百分比：
100.00%
宿主：
Rhinolophus shameli
宿主补充信息：
-
分离来源：
Feces
测序技术：
Illumina NextSeq
组装方法：
metaSPAdes
覆盖度：
68,000x
相关链接：
EPI_ISL_852605
提交者：
Vibol Hul, Deborah Delaune, Erik A Karlsson, Ou Tey Putita, Alexandre Hassanin, Artem Baidaliuk, Fabiana Gámbaro, Vuong Tan Tu, Lucy Keatts, Jonna Mazet, Christine Johnson, Philippe Buchy, Philippe Dussart, Tracey Goldstein, Etienne Simon-Lorière, Veasna Duong
提交者单位：
G5 Evolutionary Genomics of RNA viruses, Virology Department, Institut Pasteur
提交者地址：
28 rue du Docteur Roux, 75015 PARIS, FRANCE
样本信息
编号： OESV577865 采样时间： 2010-12-06
采样地点：
Asia / Cambodia / Steung Treng
地点补充信息：
-
采样单位：
Virology Unit, Institut Pasteur du Cambodge
采样地址：
5 Monivong Blvd, PO Box 983 120210, Phnom Penh, Cambodia