毒株信息
编号: OEAV577865 发布时间: 2021-01-20 基因组完整性: -
病毒类型
RNA virus
毒株名称:
hCoV-19/bat/Cambodia/RShSTT200/2010
毒株别名:
-
病毒说明:
hCoV-19/bat/Cambodia/RShSTT200/2010
物种名称:
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID:
属名:
Betacoronavirus
分类谱系:
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度:
29793
有效碱基数量:
29793
有效碱基百分比:
100.00%
宿主:
Rhinolophus shameli
宿主补充信息:
-
分离来源:
Feces
测序技术:
Illumina NextSeq
组装方法:
metaSPAdes
覆盖度:
68,000x
相关链接:
提交者:
Vibol Hul, Deborah Delaune, Erik A Karlsson, Ou Tey Putita, Alexandre Hassanin, Artem Baidaliuk, Fabiana Gámbaro, Vuong Tan Tu, Lucy Keatts, Jonna Mazet, Christine Johnson, Philippe Buchy, Philippe Dussart, Tracey Goldstein, Etienne Simon-Lorière, Veasna Duong
提交者单位:
G5 Evolutionary Genomics of RNA viruses, Virology Department, Institut Pasteur
提交者地址:
28 rue du Docteur Roux, 75015 PARIS, FRANCE
样本信息
编号: OESV577865 采样时间: 2010-12-06
采样地点:
Asia / Cambodia / Steung Treng
地点补充信息:
-
采样单位:
Virology Unit, Institut Pasteur du Cambodge
采样地址:
5 Monivong Blvd, PO Box 983 120210, Phnom Penh, Cambodia