毒株信息
编号： OEAV589855 发布时间： 2021-02-16 基因组完整性： partial
病毒类型
RNA viruses
毒株名称：
SARS-CoV-2/Felis catus/CHE/ZH-UZH-Cat1/2020 ORF1ab polyprotein (ORF1ab), ORF1a polyprotein (ORF1ab), surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), ORF6 protein (ORF6), ORF7a protein (ORF7a), ORF7b (ORF7b), ORF8 protein (ORF8), nucleocapsid phosphoprotein (N), and ORF10 protein (ORF10) genes
毒株别名：
-
病毒说明：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/Felis catus/CHE/ZH-UZH-Cat1/2020 ORF1ab polyprotein (ORF1ab), ORF1a polyprotein (ORF1ab), surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), envelope protein (E), membrane glycoprotein (M), ORF6 protein (ORF6), ORF7a protein (ORF7a), ORF7b (ORF7b), ORF8 protein (ORF8), nucleocapsid phosphoprotein (N), and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[root, Viruses, Riboviria, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus, Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]
序列长度：
29663
有效碱基数量：
29446
有效碱基百分比：
99.27%
宿主：
Felis catus
宿主补充信息：
-
分离来源：
oronasopharynx
测序技术：
Illumina
组装方法：
V-pipe v. 2.0
覆盖度：
-
相关链接：
MW600500
提交者：
Klaus,J., Meli,M.L., Hofmann-Lehmann,R., Beisel,C., Nadeau,S., Chen,C., Topolsky,I., Jablonski,P., Fuhrmann,L., Dreifuss,D., Jahn,K., Denes,R., Nissen,I., Santacroce,N., Burcklen,E., Beerenwinkel,N. and Stadler,T.
提交者单位：
Department of Biosystems Science and Engineering, ETH Zurich, Mattenstrasse 26, Basel 4058, Switzerland
提交者地址：
Department of Biosystems Science and Engineering, ETH Zurich, Mattenstrasse 26, Basel 4058, Switzerland
样本信息
编号： OESV589855 采样时间： 2020-11-16
病毒注释