毒株信息
编号： OEAV858261 发布时间： 2021-03-11 基因组完整性： partial
病毒类型
RNA viruses
毒株名称：
SARS-CoV-2/Cat/USA/FL-BPHL-1082/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab), ORF1a polyprotein (ORF1ab), surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), and envelope protein (E) genes, complete cds; membrane glycoprotein (M) and ORF7b (ORF7b) genes, partial cds; and ORF8 protein (ORF8), nucleocapsid phosphoprotein (N), and ORF10 protein (ORF10) genes
毒株别名：
-
病毒说明：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/Cat/USA/FL-BPHL-1082/2021 ORF1ab polyprotein (ORF1ab), ORF1a polyprotein (ORF1ab), surface glycoprotein (S), ORF3a protein (ORF3a), and envelope protein (E) genes, complete cds; membrane glycoprotein (M) and ORF7b (ORF7b) genes, partial cds; and ORF8 protein (ORF8), nucleocapsid phosphoprotein (N), and ORF10 protein (ORF10) genes, complete cds
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[root, Viruses, Riboviria, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus, Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2]
序列长度：
29782
有效碱基数量：
25300
有效碱基百分比：
84.95%
宿主：
Felis catus
宿主补充信息：
-
分离来源：
-
测序技术：
Illumina
组装方法：
bwa v. 0.7.17; ivar v. 1.2.2
覆盖度：
-
相关链接：
MW725610
提交者：
Schmedes,S. and Blanton,J.
提交者单位：
BPHL, FLDOH
提交者地址：
1217 N Pearl St, Jacksonville, FL 32202, USA
样本信息
编号： OESV858261 采样时间： 2021-02-22
病毒注释