毒株信息
编号: OEAV994374 发布时间: 2021-03-11 基因组完整性: -
病毒类型
RNA virus
毒株名称:
hCoV-19/cat/USA/FL-BPHL-1082/2021
毒株别名:
-
病毒说明:
hCoV-19/cat/USA/FL-BPHL-1082/2021
物种名称:
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID:
属名:
Betacoronavirus
分类谱系:
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度:
29782
有效碱基数量:
25300
有效碱基百分比:
84.95%
宿主:
Felis catus
宿主补充信息:
-
分离来源:
-
测序技术:
Illumina NextSeq
组装方法:
bwa v0.7.17; ivar v1.2.2
覆盖度:
619x
相关链接:
提交者:
Sarah Schmedes, Jason Blanton
提交者单位:
Florida Bureau of Public Health Laboratories
提交者地址:
1217 N. Pearl Street Jacksonville, FL 32202
样本信息
编号: OESV994374 采样时间: 2021-02-22
采样地点:
North America / USA / Florida
地点补充信息:
-
采样单位:
Florida Bureau of Public Health Laboratories
采样地址:
1217 N. Pearl Street Jacksonville, FL 32202