毒株信息
编号： OEAV000018 发布时间： 2020-02-21 基因组完整性： complete
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/Cambodia/0012/2020
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/Cambodia/0012/2020
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29873
有效碱基数量：
29873
有效碱基百分比：
100.00%
宿主：
Homo sapiens
宿主补充信息：
Patient from Wuhan, China
分离来源：
Nasopharyngeal swab and oropharyngeal swab
测序技术：
Illumina iSeq
组装方法：
Geneious Prime 2020.0.5
覆盖度：
15X
相关链接：
EPI_ISL_411902
提交者：
Erik A Karlsson, Jennifer A Bohl, Vida Ahyong, Veasna Duong, Philippe Dussart, Jessica E Manning.
提交者单位：
Virology Unit, Institut Pasteur du Cambodge (Sequencing done by: Jessica E Manning/Jennifer A Bohl at Malaria and Vector Research Research Laboratory, National Institute of Allergy and Infectious Diseases and Vida Ahyong from Chan-Zuckerberg Biohub)
提交者地址：
1) Malaria and Vector Research Research Laboratory, National Institute of Allergy and Infectious Diseases, Phnom Penh, Cambodia2) Chan-Zuckerberg Biohub, San Francisco, California, USA3) Institut Pasteur du Cambodge, Phnom Penh, Cambodia
样本信息
编号： OESV000018 采样时间： 2020-01-27
采样地点：
Asia / Cambodia / Sihanoukville
地点补充信息：
-
宿主编号：
-
宿主性别：
Male
宿主年龄：
60
采样单位：
Virology Unit, Institut Pasteur du Cambodge.
采样地址：
5 Monivong Blvd. PO Box 983, Phnom Penh, Cambodia