毒株信息
编号： OEAV000046 发布时间： 2020-02-03 基因组完整性： complete
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/England/01/2020
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/England/01/2020
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29838
有效碱基数量：
29837
有效碱基百分比：
100.00%
宿主：
Homo sapiens
宿主补充信息：
-
分离来源：
swab
测序技术：
Illumina HiSeq
组装方法：
PHE pipeline (BWA-SAMtools-Quasibam)
覆盖度：
13,000x
相关链接：
EPI_ISL_407071
提交者：
Monica Galiano, Shahjahan Miah, Richard Myers, Angie Lackenby, Omolola Akinbami, Tiina Talts, Leena Bhaw, Kirstin Edwards, Jonathan Hubb, Joanna Ellis, Maria Zambon
提交者单位：
Respiratory Virus Unit, Microbiology Services Colindale, Public Health England
提交者地址：
61 Colindale Avenue, London, NW9 5EQ, United Kingdom
样本信息
编号： OESV000046 采样时间： 2020-01-29
采样地点：
Europe / United Kingdom / England
地点补充信息：
-
宿主编号：
-
宿主性别：
Female
宿主年龄：
50
采样单位：
Respiratory Virus Unit, Microbiology Services Colindale, Public Health England
采样地址：
61 Colindale Avenue, London, NW9 5EQ, United Kingdom