毒株信息
编号： OEAV000049 发布时间： 2020-02-03 基因组完整性： complete
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/Finland/1/2020
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/Finland/1/2020
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29847
有效碱基数量：
29684
有效碱基百分比：
99.45%
宿主：
Homo sapiens
宿主补充信息：
-
分离来源：
nasopharyngeal swab
测序技术：
Illumina Miseq
组装方法：
MEGAHIT, BWA-MEM
覆盖度：
20x
相关链接：
EPI_ISL_407079
提交者：
Teemu Smura, Suvi Kuivanen, Hannimari Kallio-Kokko, Olli Vapalahti
提交者单位：
Department of Virology, University of Helsinki and Helsinki University Hospital, Helsinki, Finland
提交者地址：
Haartmaninkatu 3, 00290 Helsinki, Finland
样本信息
编号： OESV000049 采样时间： 2020-01-29
采样地点：
Europe / Finland / Lapland
地点补充信息：
Lapland Hospital District
宿主编号：
-
宿主性别：
Female
宿主年龄：
32
采样单位：
Lapland Central Hospital
采样地址：
Lapland Hospital District, P.O. Box 8041, 96101 Finland