毒株信息
编号: OEAV000050 发布时间: 2020-03-01 基因组完整性: complete
病毒类型
RNA virus
毒株名称:
hCoV-19/Finland/FIN-25/2020
毒株别名:
-
病毒说明:
hCoV-19/Finland/FIN-25/2020
物种名称:
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID:
属名:
Betacoronavirus
分类谱系:
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度:
29776
有效碱基数量:
29373
有效碱基百分比:
98.65%
宿主:
Homo sapiens
宿主补充信息:
Patient infected in Milan, Italy
分离来源:
Naso-pharyngeal swab
测序技术:
Illumina Miseq
组装方法:
BWA-MEM
覆盖度:
900x (average)
相关链接:
提交者:
Teemu Smura, Suvi Kuivanen, Hannimari Kallio-Kokko, Olli Vapalahti
提交者单位:
Department of Virology Faculty of Medicine, Medicum University of Helsinki
提交者地址:
Haartmaninkatu 3, 00290 Helsinki Finland
样本信息
编号: OESV000050 采样时间: 2020-02-25
采样地点:
Europe / Finland / Helsinki
地点补充信息:
-
宿主编号:
-
宿主性别:
Female
宿主年龄:
24
采样单位:
HUS Diagnostiikkakeskus, Hallinto
采样地址:
PL 720, 00029 HUS, Topeliuksenkatu 32, 00290 Helsinki Finland