毒株信息
编号： OEAV000058 发布时间： 2020-02-19 基因组完整性： complete
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/France/IDF-0386-islP3/2020
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/France/IDF-0386-islP3/2020
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29878
有效碱基数量：
29878
有效碱基百分比：
100.00%
宿主：
Homo sapiens
宿主补充信息：
related to EPI_ISL_406596
分离来源：
Naso-pharyngeal swab
测序技术：
Illumina MiSeq / Zymo-Seq RiboFree
组装方法：
mapping with hisat2 and consensus
覆盖度：
1500x
相关链接：
EPI_ISL_411220
提交者：
Olivier Terrier, Aurélien Traversier, Julien Fouret, Yazdan Yazdanpanah, Xavier Lescure, Alexandre Gaymard, Bruno Lina, Manuel Rosa-Calatrava
提交者单位：
Laboratoire Virpath, CIRI U111, UCBL1, INSERM, CNRS, ENS Lyon
提交者地址：
7-11 rue Guillaume Paradin Lyon
样本信息
编号： OESV000058 采样时间： 2020-01-28
采样地点：
Europe / France / Île-de-France / Paris
地点补充信息：
-
宿主编号：
-
宿主性别：
Female
宿主年龄：
30
采样单位：
Department of Infectious and Tropical Diseases, Bichat Claude Bernard Hospital, Paris
采样地址：
46, rue Henri Huchard75018 ParisFrance