毒株信息
编号： OEAV000062 发布时间： 2020-02-14 基因组完整性： complete
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/France/ARA-739/2020
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/France/ARA-739/2020
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29754
有效碱基数量：
29754
有效碱基百分比：
100.00%
宿主：
Homo sapiens
宿主补充信息：
-
分离来源：
Oro-pharyngeal swab
测序技术：
Illumina NextSeq 500
组装方法：
BWA (Burrows-Wheeler Aligner method), samtools
覆盖度：
4,800x (average) , 100x (min)
相关链接：
EPI_ISL_410486
提交者：
Bal, Antonin; Destras, Gregory; Gaymard, Alexandre; Bouscambert-Duchamp, Maude; Cheynet, Valérie; Brengel-Pesce, Karen; Morfin-Sherpa, Florence; Valette, Martine; Josset, Laurence; Lina, Bruno.
提交者单位：
CNR Virus des Infections Respiratoires - France SUD
提交者地址：
103 Grande Rue de la Croix-Rousse, 69317 cedex 04 Lyon, France
样本信息
编号： OESV000062 采样时间： 2020-02-08
采样地点：
Europe / France / Auvergne-Rhone-Alpes / Contamines
地点补充信息：
-
宿主编号：
-
宿主性别：
Female
宿主年龄：
56
采样单位：
CNR Virus des Infections Respiratoires - France SUD
采样地址：
103 Grande Rue de la Croix-Rousse, 69317 cedex 04 Lyon, France