毒株信息
编号： OEAV000112 发布时间： 2020-03-01 基因组完整性： complete
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/Italy/LOM-ASST-CDG1/2020
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/Italy/LOM-ASST-CDG1/2020
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29903
有效碱基数量：
29901
有效碱基百分比：
99.99%
宿主：
Homo sapiens
宿主补充信息：
-
分离来源：
Oro-pharyngeal swab
测序技术：
Illumina Miseq
组装方法：
Geneious Prime BWA-MEM
覆盖度：
1,000 X
相关链接：
EPI_ISL_412973
提交者：
Paola Stefanelli, Stefano Fiore, Antonella Marchi, Eleonora Benedetti, Concetta Fabiani, Giovanni Faggioni, Antonella Fortunato, Riccardo De Santis, Silvia Fillo, Anna Anselmo, Andrea Ciammaruconi, Stefano Palomba, Florigio Lista
提交者单位：
Virology Laboratory, Scientific Department, Army Medical Center
提交者地址：
Via Santo Stefano Rotondo 4, 00184 Rome, ITALY
样本信息
编号： OESV000112 采样时间： 2020-02-20
采样地点：
Europe / Italy / Lombardy
地点补充信息：
-
宿主编号：
-
宿主性别：
Male
宿主年龄：
38
采样单位：
Department of Infectious Diseases, Istituto Superiore di Sanità, Roma , Italy
采样地址：
Viale Regina Elena 299, 00161 Rome, ITALY