毒株信息
编号： OEAV000124 发布时间： 2020-03-05 基因组完整性： complete
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/Japan/TK-20-31-3/2020
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/Japan/TK-20-31-3/2020
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29635
有效碱基数量：
29635
有效碱基百分比：
100.00%
宿主：
Homo sapiens
宿主补充信息：
Pneumonia (Chest X-ray, CT)
分离来源：
Autopsy, Bronch and lung
测序技术：
NextSeq500
组装方法：
A5-miseq v. 20140604
覆盖度：
1,500x
相关链接：
EPI_ISL_413459
提交者：
Tsuyoshi Sekizuka, Kentaro Itokawa, Takuya Adachi, Masahiro Sano, Jun Yamazaki, Ippei Miyamoto, Haruka Nishioka, Ja-Mun Chong, Noriko Nakajima, Yuko Sato, Minoru Tobiume, Harutaka Katano, Tadaki Suzuki, Makoto Kuroda
提交者单位：
Pathogen Genomics Center, National Institute of Infectious Diseases
提交者地址：
1-23-1 Toyama, Shinjuku-ku, Tokyo 162-8640, Japan
样本信息
编号： OESV000124 采样时间： 2020-02-20
采样地点：
Asia / Japan / Tokyo
地点补充信息：
Diamond Princess cruise ship
宿主编号：
-
宿主性别：
Female
宿主年龄：
84
采样单位：
Department of Pathology, Toshima Hospital
采样地址：
33-1 Sakaecho, Itabashi-ku, Tokyo, 173-0015, Japan