毒株信息
编号： OEAV000144 发布时间： 2020-03-01 基因组完整性： complete
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/Mexico/CMX-InDRE-01/2020
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/Mexico/CMX-InDRE-01/2020
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29903
有效碱基数量：
29903
有效碱基百分比：
100.00%
宿主：
Homo sapiens
宿主补充信息：
Patient infected in Bergamo, Italy
分离来源：
Naso-pharyngeal swab
测序技术：
Ion Torrent
组装方法：
Coronavirus Typing Tool, Genome Detective
覆盖度：
3983X
相关链接：
EPI_ISL_412972
提交者：
Ramirez-Gonzalez Ernesto, Garces-Ayala Fabiola, Araiza-Rodriguez Adnan, Mendieta-Condado Edgar, Rodriguez-Maldonado Abril, Wong-Arambula Claudia, Vazquez-Perez Joel, Martinez Arturo, Boukadida Celia, Munoz-Medina Esteban, Sanchez Alejandro, Isa Pavel, Taboada Blanca, Lopez Susana, Arias Carlos, Barrera-Badillo Gisela, Hernandez-Rivas Lucia, Lopez-Martinez Irma
提交者单位：
Instituto de Diagnostico y Referencia Epidemiologicos (INDRE)
提交者地址：
Francisco de P. Miranda 177bis Colonia Lomas de Plateros Delegación Álvaro Obregón, C.P. 01480, Mexico City, Mexico.
样本信息
编号： OESV000144 采样时间： 2020-02-27
采样地点：
North America / Mexico / Mexico City
地点补充信息：
-
宿主编号：
-
宿主性别：
Male
宿主年龄：
35
采样单位：
Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias
采样地址：
Calz. de Tlalpan 4502, Belisario Domínguez Secc 16, Tlalpan, 14080 Ciudad de México, CDMX