毒株信息
编号： OEAV000145 发布时间： 2020-02-14 基因组完整性： complete
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/Nepal/61/2020
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/Nepal/61/2020
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29811
有效碱基数量：
29811
有效碱基百分比：
100.00%
宿主：
Homo sapiens
宿主补充信息：
-
分离来源：
Oro-pharyngeal swab
测序技术：
Illumina Miseq
组装方法：
BWA-mem 0.7.5a-r405
覆盖度：
77000x
相关链接：
EPI_ISL_410301
提交者：
Ranjit Sah , Runa Jha, Daniel Chu, Haogao Gu, Malik Peiris, Anup Bastola, Alfonso J. Rodriguez-Morales, Bibek Kumar Lal, Basu Dev Pandey, Leo Poon
提交者单位：
The University of Hong Kong
提交者地址：
Pokfulam Road Queen Mary Hospital, Hong Kong, Hong Kong (SAR)
样本信息
编号： OESV000145 采样时间： 2020-01-13
采样地点：
Asia / Nepal / Kathmandu
地点补充信息：
National Influenza Centre, NPHL, Kathmandu, Nepal
宿主编号：
-
宿主性别：
Male
宿主年龄：
32
采样单位：
National Influenza Centre, National Public Health Laboratory, Kathmandu, Nepal
采样地址：
Pachali Marg, Teku, Kathmandu, Nepal (44600)