毒株信息
编号： OEAV000153 发布时间： 2020-03-04 基因组完整性： complete
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/Scotland/CVR01/2020
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/Scotland/CVR01/2020
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29782
有效碱基数量：
29514
有效碱基百分比：
99.10%
宿主：
Homo sapiens
宿主补充信息：
-
分离来源：
-
测序技术：
Nanopore MinION
组装方法：
Artic Protocol
覆盖度：
20x
相关链接：
EPI_ISL_413221
提交者：
Emma Thomson, Antonia Ho; James Shephard, Shirin Ashraf; Kathy Smollett, Daniel Mair, Stephen Carmichael, Ana da Silva Filipe; Richard Orton, Josh Singer, David L Robertson; Andrew Rambaut; Alasdair MacLean, Rory Gunson.
提交者单位：
MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research
提交者地址：
Sir Michael Stoker Building, Garscube Campus, 464 Bearsden Road, Glasgow G61 1QH, Scotland, United Kingdom
样本信息
编号： OESV000153 采样时间： 2020-02-28
采样地点：
Europe / United Kingdom / Scotland
地点补充信息：
-
宿主编号：
-
宿主性别：
Male
宿主年龄：
51
采样单位：
West of Scotland Specialist Virology Centre, NHSGGC
采样地址：
New Lister Building, Glasgow Royal Infirmary, 10-16 Alexandra Parade - Level 5, Glasgow G31 2ER, Scotland, United Kingdom