毒株信息
编号： OEAV000173 发布时间： 2020-01-24 基因组完整性： complete
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/Shenzhen/HKU-SZ-005/2020
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/Shenzhen/HKU-SZ-005/2020
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29891
有效碱基数量：
29891
有效碱基百分比：
100.00%
宿主：
Homo sapiens
宿主补充信息：
-
分离来源：
Sputum
测序技术：
Nanopore MinION
组装方法：
minimap2
覆盖度：
-
相关链接：
EPI_ISL_405839
提交者：
Chan,J.F.-W., Yuan,S., Kok,K.H., To,K.K.-W., Chu,H., Yang,J., Xing,F., Liu,J., Yip,C.C.-Y., Poon,R.W.-S., Tsai,H.W., Lo,S.K.-F., Chan,K.H., Poon,V.K.-M., Chan,W.M., Ip,J.D., Cai,J.P., Cheng,V.C.-C., Chen,H., Hui,C.K.-M. and Yuen,K.Y.
提交者单位：
Li Ka Shing Faculty of Medicine, The University of Hong Kong
提交者地址：
21 Sassoon Road, Pokfulam, Hong Kong, Hong Kong (SAR)
样本信息
编号： OESV000173 采样时间： 2020-01-11
采样地点：
Asia / China / Guangdong / Shenzhen
地点补充信息：
-
宿主编号：
-
宿主性别：
Male
宿主年龄：
10
采样单位：
The University of Hong Kong - Shenzhen Hospital
采样地址：
1 Haiyuan 1st Road, Futian District, Shenzhen 518053, Guangdong, China