毒株信息
编号： OEAV000198 发布时间： 2020-03-03 基因组完整性： complete
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/Switzerland/ZH-UZH-1000477796/2020
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/Switzerland/ZH-UZH-1000477796/2020
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29845
有效碱基数量：
29845
有效碱基百分比：
100.00%
宿主：
Homo sapiens
宿主补充信息：
-
分离来源：
Oro-pharyngeal swab
测序技术：
Illumina Miseq
组装方法：
SMALT, 15% ambiguity threshold
覆盖度：
35x (average)
相关链接：
EPI_ISL_413022
提交者：
Stefan Schmutz, Maryam Zaheri, Verena Kufner, Gabriela Ziltener, Patrick Redli, Fiona Steiner, Jon Huder, Riccarda Capaul, Andrea Zbinden, Jürg Böni, Michael Huber, Roberto Speck, Alexandra Trkola
提交者单位：
Institute of Medical Virology, University of Zurich
提交者地址：
Winterthurerstrasse 190, 8057 Zürich, Switzerland
样本信息
编号： OESV000198 采样时间： 2020-02-29
采样地点：
Europe / Switzerland / Zurich
地点补充信息：
-
宿主编号：
-
宿主性别：
Male
宿主年龄：
27
采样单位：
Division of Infectious Diseases, University Hospital Zurich
采样地址：
Rämistrasse 100, 8091 Zurich, Switzerland