毒株信息
编号： OEAV000219 发布时间： 2020-01-25 基因组完整性： complete
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/USA/IL1/2020
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/USA/IL1/2020
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29882
有效碱基数量：
29874
有效碱基百分比：
99.97%
宿主：
Homo sapiens
宿主补充信息：
-
分离来源：
sputum
测序技术：
Sanger; Nanopore
组装方法：
minimap 2.17
覆盖度：
>20X
相关链接：
EPI_ISL_404253
提交者：
Ying Tao, Krista Queen, Clinton R. Paden, Jing Zhang, Yan Li, Anna Uehara, Xiaoyan Lu, Brian Lynch, Senthil Kumar K. Sakthivel, Brett L. Whitaker, Shifaq Kamili, Lijuan Wang, Janna' R. Murray, Susan I. Gerber, Stephen Lindstrom, Suxiang Tong
提交者单位：
Pathogen Discovery, Respiratory Viruses Branch, Division of Viral Diseases, Centers for Dieases Control and Prevention
提交者地址：
1600 Clifton Rd NE, Atlanta GA 30329
样本信息
编号： OESV000219 采样时间： 2020-01-21
采样地点：
North America / USA / Illinois / Chicago
地点补充信息：
-
宿主编号：
-
宿主性别：
Female
宿主年龄：
63
采样单位：
IL Department of Public Health Chicago Laboratory
采样地址：
2121 West Taylor, Chicago IL 60612