毒株信息
编号: OEAV000231 发布时间: 2020-03-05 基因组完整性: complete
病毒类型
RNA virus
毒株名称:
hCoV-19/USA/WA8-UW5/2020
毒株别名:
-
病毒说明:
hCoV-19/USA/WA8-UW5/2020
物种名称:
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID:
属名:
Betacoronavirus
分类谱系:
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度:
29732
有效碱基数量:
29732
有效碱基百分比:
100.00%
宿主:
Homo sapiens
宿主补充信息:
-
分离来源:
-
测序技术:
Illumina Miseq
组装方法:
Geneious Prime 2020.0.5
覆盖度:
375x average
相关链接:
提交者:
Pavitra Roychoudhury, Arun Nalla, Hong Xie, Keith Jerome, Alexander Greninger
提交者单位:
University of Washington Virology Lab
提交者地址:
Seattle WA 98102-1024
样本信息
编号: OESV000231 采样时间: 2020-03-01
采样地点:
North America / USA / Washington
地点补充信息:
-
采样单位:
Valley Medical Center
采样地址:
400 S 43rd Street, Renton, WA 98055