毒株信息
编号： OEAV000280 发布时间： 2020-03-01 基因组完整性： complete
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/USA/WA2/2020
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/USA/WA2/2020
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29850
有效碱基数量：
29850
有效碱基百分比：
100.00%
宿主：
Homo sapiens
宿主补充信息：
-
分离来源：
Mid-nasal swab
测序技术：
Illumina Nextseq
组装方法：
https://github.com/seattleflu/assembly
覆盖度：
184x (average)
相关链接：
EPI_ISL_412970
提交者：
Helen Chu, Michael Boeckh, Janet Englund, Michael Famulare, Barry Lutz, Deborah Nickerson, Mark Rieder, Lea Starita, Matthew Thompson, Jay Shendure, and Trevor Bedford
提交者单位：
Seattle Flu Study
提交者地址：
University of Washington Medical Center, 1959 NE Pacific Street, Seattle, WA 98195, USA
样本信息
编号： OESV000280 采样时间： 2020-02-24
采样地点：
North America / USA / Washington / Snohomish County
地点补充信息：
-
宿主编号：
-
宿主性别：
Male
宿主年龄：
17
采样单位：
Washington State Department of Health
采样地址：
1610 NE 150th Street, Shoreline, WA 98155 USA