毒株信息
编号： OEAV000281 发布时间： 2020-03-02 基因组完整性： complete
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/Brazil/SP-02/2020
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/Brazil/SP-02/2020
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29782
有效碱基数量：
29782
有效碱基百分比：
100.00%
宿主：
Homo sapiens
宿主补充信息：
Patient who traveled to Italy and passed through Milan
分离来源：
Naso-pharyngeal swab
测序技术：
Nanopore MinION
组装方法：
Minimap2, Samtools
覆盖度：
1,051.895x
相关链接：
EPI_ISL_413016
提交者：
Jaqueline Goes de Jesus, Claudio Tavares Sacchi, Fabiana Cristina Pereira dos Santos, Ingra Morales Claro, Flávia Cristina da Silva Sales, Claudia Regina Gonçalves, Joshua Quick, Maria do Carmo Sampaio Tavares Timenetsky, Nicholas James Loman, Andrew Rambaut, Ester Cerdeira Sabino, Nuno Rodrigues Faria
提交者单位：
Instituto Adolfo Lutz, Interdisciplinary Procedures Center, Strategic Laboratory
提交者地址：
Av. Dr. Arnaldo, 355 - Brazil, Cerqueira Cesar, Sao Paulo - SP, 01246-902
样本信息
编号： OESV000281 采样时间： 2020-02-28
采样地点：
South America / Brazil / Sao Paulo / Sao Paulo
地点补充信息：
-
宿主编号：
-
宿主性别：
Male
宿主年龄：
32
采样单位：
Hospital Israelita Albert Einstein
采样地址：
Av. Albert Eistein, 627 - Jardim Leonor, Brazil, Sao Paulo - SP, 05652-900