毒株信息
编号: OEAV000282 发布时间: 2020-02-08 基因组完整性: complete
病毒类型
RNA virus
毒株名称:
hCoV-19/France/IDF-0626/2020
毒株别名:
-
病毒说明:
hCoV-19/France/IDF-0626/2020
物种名称:
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID:
属名:
Betacoronavirus
分类谱系:
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度:
29851
有效碱基数量:
29851
有效碱基百分比:
100.00%
宿主:
Homo sapiens
宿主补充信息:
-
分离来源:
Oro-pharyngeal swab
测序技术:
Illumina NextSeq 500
组装方法:
CLC Genomics Workbench 20
覆盖度:
500x
相关链接:
提交者:
Mélanie Albert, Marion Barbet, Sylvie Behillil, Méline Bizard, Angela Brisebarre, Flora Donati, Vincent Enouf, Maud Vanpeene, Sylvie van der Werf, Sonia Burrel, Anne-Geneviève Marcelin, Vincent Calvez, David Boutolleau, Elise Klément, Valérie Pourcher, Eric Caumes.
提交者单位:
National Reference Center for Viruses of Respiratory Infections, Institut Pasteur, Paris
提交者地址:
28 rue du Docteur Roux75015 ParisFrance
样本信息
编号: OESV000282 采样时间: 2020-01-29
采样地点:
Europe / France / Île-de-France / Paris
地点补充信息:
-
宿主编号:
-
宿主性别:
Male
宿主年龄:
53
采样单位:
Sorbonne Université, Inserm et Assistance Publique-Hôpitaux de Paris (Pitié Salpétrière)
采样地址:
47-83 Boulevard de l'Hôpital75013 Paris