毒株信息
编号： OEAV000300 发布时间： 2020-03-10 基因组完整性： complete
病毒类型
RNA virus
毒株名称：
hCoV-19/Brazil/SP-06/2020
毒株别名：
-
病毒说明：
hCoV-19/Brazil/SP-06/2020
物种名称：
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
物种ID：
2697049
属名：
Betacoronavirus
分类谱系：
[Viruses, Riboviria, Orthornavirae, Pisuviricota, Pisoniviricetes, Nidovirales, Cornidovirineae, Coronaviridae, Orthocoronavirinae, Betacoronavirus, Sarbecovirus, Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus]
序列长度：
29886
有效碱基数量：
29886
有效碱基百分比：
100.00%
宿主：
Homo sapiens
宿主补充信息：
Contact of hCoV-19/Brazil/SPBR-01/2020
分离来源：
Naso-pharyngeal swab
测序技术：
Ion Torrent S5
组装方法：
SPADes
覆盖度：
15,689x
相关链接：
EPI_ISL_414015
提交者：
Claudio Tavares Sacchi, Claudia Regina Gonçalves, SimoneGuadagnucci Morillo, Carlos Henrique Camargo, Maria do Carmo Sampaito Tavares Timenetsky, Fabiana Cristina Pereira dos Santos Terezinha Maria de Paiva, Ester Cerdeira Sabino
提交者单位：
Instituto Adolfo Lutz, Interdiciplinary Procedures Center, Strategic Laboratory
提交者地址：
Av. Dr. Arnaldo, 355 - Brazil, Cerqueira Cesar, São Paulo - SP, 01246-902
样本信息
编号： OESV000300 采样时间： 2020-02-29
采样地点：
South America / Brazil / Sao Paulo / Sao Paulo
地点补充信息：
-
宿主编号：
-
宿主性别：
Female
宿主年龄：
69
采样单位：
Hospital São Joaquim Beneficencia Portuguesa
采样地址：
Rua Maestro Cardim, 769 - Bela Vista, São Paulo - SP, 01323-001